Depuis sa création, l'Université de Haute-Alsace se distingue par un recherche partenariale très active, en collaboration avec des acteurs économiques locaux, nationaux et internationaux. Elle place la recherche à la pointe de l'innovation dans des domaines qui définissent ses forces :

• chimie et matériaux fonctionnels,
• mobilités
• risques
• interculturalités.

La recherche à l'UHA est interdisciplinaire et à l'origine de nombreuses innovations de rupture (matériaux, véhicule autonome, bâtiments intelligents...). Elle a contribuer à valoriser des thématiques scientifiques de niche telles que le stockage de l'énergie, l'industrie du futur, la vigne, le textile, le décrochage scolaire, l'interculturalité ou encore l'autonomie.